フラット35「買取型」の仕組みは次のような流れになっています。これにより、民間金融機関は、金利変動リスクを負うことなく資金調達を行うことができるようになり、低利で長期の住宅ローンの販売が可能になります。

■民間金融機関が顧客に長期・固定金利の住宅ローンを融資し、そのローン債権を住宅金融支援機構に売却します。
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■住宅金融支援機構は、ローン債券を信託会社に信託し、資産担保証券を発行して投資家に売却します。この売却代金が住宅ローンの買取代金になります。
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■期日通りの元利支払が投資家に行われます。

フラット35「保証型」の場合は、民間金融機関等が独自に証券化するので、民間金融機関は住宅ローン債権を住宅金融支援機構に売却はしません。

つまり、あくまでも住宅金融支援機構は、そのローン債権を証券化した「MBS」の元利金の支払いを保証し、返済が滞った場合には民間金融機関等に保険の支払いを行うのみということです。

よって、「保証型」の場合は、民間金融機関の独自性が出しやすい、限りなく民間住宅ローンに近い商品であるといえます。